More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_r1 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  98.89 
 
 		 1548 bp  1183    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  88.85 
 
 		 1551 bp  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  97.94 
 
 		 1548 bp  1136    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  97.94 
 
 		 1548 bp  1136    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_r1  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 628 bp  1245    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  97.94 
 
 		 1548 bp  1136    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  97.94 
 
 		 1548 bp  1136    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  97.94 
 
 		 1548 bp  1136    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0079  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1550 bp  557  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.940903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0409  16S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 1550 bp  557  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0181  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1550 bp  549  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0168  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1550 bp  549  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1784  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1550 bp  549  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0019  16S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 1550 bp  549  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1544 bp  361  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1544 bp  353  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1544 bp  353  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1510 bp  353  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1503 bp  353  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1507 bp  353  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1545 bp  353  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1544 bp  353  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1544 bp  353  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1544 bp  353  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 1544 bp  351  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1544 bp  345  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1545 bp  345  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1508 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1508 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1508 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1508 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1508 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1562 bp  345  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1555 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1509 bp  345  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1503 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1503 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1510 bp  345  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1506 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SK  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 1507 bp  345  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>