16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0608 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00185392  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5757  hypothetical protein  52.55 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0474  hypothetical protein  55.88 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8358  hypothetical protein  54.2 
 
 		 247 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0226  hypothetical protein  50.6 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10504  hypothetical protein  49.45 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00448932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4596  hypothetical protein  49 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0663  hypothetical protein  47.97 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0676  hypothetical protein  47.97 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0656  hypothetical protein  47.97 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.678688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0998  hypothetical protein  47.29 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0405  hypothetical protein  48.89 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0338  hypothetical protein  50.86 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0080  hypothetical protein  44.65 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0655  hypothetical protein  48.36 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0832  hypothetical protein  45.76 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026947  normal  0.932772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>