15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0050 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0050  metal dependent phophohydrolase  100 
 
 
230 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.11524  normal  0.597591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1720  metal dependent phophohydrolase  44.95 
 
 
187 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000565777  normal  0.121963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1134  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3030  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5596  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5997  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000525134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3233  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 
178 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358695  normal  0.837173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3183  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 
178 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8674  hypothetical protein  37.82 
 
 
195 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8968  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  normal  0.622726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1524  metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5474  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
184 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729398  normal  0.570702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3171  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 
155 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5334  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 
182 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4858  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>