14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3938 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3938  DsrF protein  100 
 
 
117 aa  230  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.253027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2482  DsrF protein  29.41 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.067971  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.35 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  26.5 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.35 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.35 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  28.83 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  26.5 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000109278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  23.08 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0434  DsrE-like protein  32.26 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  27.03 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1954  DsrE family protein  27.93 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.414828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  25.6 
 
 
114 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  26.89 
 
 
114 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>