14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0938 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0938  XapX domain protein  100 
 
 
64 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1387  hypothetical protein  57.81 
 
 
64 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529463  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1667  hypothetical protein  58.33 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301712  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3130  XapX domain protein  53.12 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.322384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18070  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3456  XapX domain protein  52.08 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3347  hypothetical protein  53.33 
 
 
55 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1776  hypothetical protein  46 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2357  hypothetical protein  52.17 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.231966  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0618  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3182  hypothetical protein  47.22 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0053  hypothetical protein  36.96 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000391068  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1257  conserved hypothetical protein  48.78 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2559  hypothetical protein  48.78 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000873429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>