14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12220 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12220  uncharacterized integral membrane protein  100 
 
 
115 aa  227  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000214292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1682  hypothetical protein  37.93 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00011162  normal  0.0658784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2118  hypothetical protein  33.8 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2295  hypothetical protein  33.96 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0561  hypothetical protein  37.29 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0480  hypothetical protein  27.52 
 
 
117 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00952747  hitchhiker  0.0000360916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0304  hypothetical protein  27.52 
 
 
117 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4434  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1067  hypothetical protein  30.67 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525642  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2348  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0334882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1616  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1423  hypothetical protein  26.96 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000706417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1917  hypothetical protein  28.92 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2037  hypothetical protein  23.36 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.45397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>