20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4747 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4747  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0684106  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2057  hypothetical protein  48.39 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2624  hypothetical protein  46.24 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4692  hypothetical protein  38.83 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2099  hypothetical protein  35.48 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.352052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0557  hypothetical protein  45.56 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4566  hypothetical protein  35.48 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1764  hypothetical protein  36.17 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.556792  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1413  hypothetical protein  35.11 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1223  hypothetical protein  44.26 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7582  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.870331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0062  hypothetical protein  39.73 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.143041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3473  hypothetical protein  35.42 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415085  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5398  hypothetical protein  39.73 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2710  hypothetical protein  32.98 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1112  hypothetical protein  38.04 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.358741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3077  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1240  hypothetical protein  41.98 
 
 
101 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13171  hypothetical protein  32.22 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1997  hypothetical protein  34.07 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>