11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0038 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0038  tRNA-Tyr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0270674  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0040  tRNA-Tyr  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0002  tRNA-Tyr  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0054  tRNA-Tyr  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0017  tRNA-Tyr  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.011129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0006  tRNA-Phe  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000148153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  86.15 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  86.15 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  86.15 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255703  normal  0.134128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>