12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3650 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3650  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1183  hypothetical protein  67.26 
 
 		 117 aa  164  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0593  hypothetical protein  52.83 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0120  hypothetical protein  43.64 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0904998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0121  hypothetical protein  42.37 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0467104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1435  hypothetical protein  44.87 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3763  hypothetical protein  34.45 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0417595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2533  hypothetical protein  44.87 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3384  hypothetical protein  29.73 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1950  hypothetical protein  33.67 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2796  transcriptional repressor, CopY family  30.28 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1031  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>