8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2998 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2998  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  214  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3640  hypothetical protein  79.44 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2834  hypothetical protein  78.5 
 
 
107 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3112  hypothetical protein  78.5 
 
 
107 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4201  hypothetical protein  71.7 
 
 
107 aa  156  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.526185  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3248  hypothetical protein  82.93 
 
 
58 aa  80.1  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.498156 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5191  hypothetical protein  37.96 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3381  hypothetical protein  35.58 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>