10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2489 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2489  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  303  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974884  normal  0.279759 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4338  hypothetical protein  56.62 
 
 
154 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2586  hypothetical protein  60.15 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.193715  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3887  hypothetical protein  41.84 
 
 
133 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0787  hypothetical protein  39.75 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.559958  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1181  hypothetical protein  37.16 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.804363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3034  hypothetical protein  38.85 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.199095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0816  hypothetical protein  31.34 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0494  hypothetical protein  31.03 
 
 
179 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2807  hypothetical protein  29.85 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>