11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2235 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2235  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0119  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  148  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.620006  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2907  hypothetical protein  42.93 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2591  hypothetical protein  39.44 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4415  hypothetical protein  39.6 
 
 
203 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0804  hypothetical protein  37.68 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2049  hypothetical protein  38.38 
 
 
202 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0821  hypothetical protein  33.82 
 
 
215 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4715  hypothetical protein  34.98 
 
 
209 aa  94  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  47.42 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3953  hypothetical protein  29.65 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>