26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0946 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0946  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1073  hypothetical protein  49.62 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1547  hypothetical protein  39.58 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0185  hypothetical protein  39.72 
 
 
142 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112229  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1853  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2922  hypothetical protein  34.06 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01920  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0309  hypothetical protein  31.51 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1756  hypothetical protein  37.04 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000681042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2398  hypothetical protein  40.17 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.491946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2444  hypothetical protein  40.17 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1979  hypothetical protein  32.35 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00338876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0641  hypothetical protein  33.57 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3440  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.732544  hitchhiker  0.0000000000043625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1964  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00442398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3537  hypothetical protein  28.89 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2190  hypothetical protein  31.11 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.697092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3231  hypothetical protein  30.37 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.338729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3576  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3316  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.638111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3531  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3279  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.136575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3535  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1734  hypothetical protein  28.89 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3516  hypothetical protein  28.89 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3227  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.430791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>