8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3652 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3652  rhodopsin  100 
 
 		 365 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1795  rhodopsin  51.54 
 
 		 312 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2966  rhodopsin  32.93 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1643  rhodopsin  26.94 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6515  rhodopsin  24.59 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02160  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3441  rhodopsin  27.62 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000429167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2680  rhodopsin  31.25 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>