14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1096 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1096  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
155 aa  302  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5814  hypothetical protein  56.25 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06350  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  47.68 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0780  hypothetical protein  48.67 
 
 
143 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2408  hypothetical protein  47.83 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1177  hypothetical protein  51.64 
 
 
153 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2147  hypothetical protein  40.6 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483814  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0704  hypothetical protein  35.46 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673161  normal  0.376338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.125343  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1459  hypothetical protein  31.36 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  27.05 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  28.45 
 
 
158 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0781  Polyketide cyclase/dehydrase  39.73 
 
 
192 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>