18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1054 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1054  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0706  hypothetical protein  52.08 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0730  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.548837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0744  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894125  normal  0.0470253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0724  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.204776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0029  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0941  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0933351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2079  hypothetical protein  44.33 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.241558  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10554  hypothetical protein  45.05 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122166  normal  0.19156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0190  hypothetical protein  39.22 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055582  normal  0.0653987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13062  hypothetical protein  40.4 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.14878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1053  hypothetical protein  37.14 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0705  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0741  hypothetical protein  44.12 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.986315  normal  0.0900571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0721  hypothetical protein  44.12 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99506  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4280  hypothetical protein  41.84 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393195  normal  0.617607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0032  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346325  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0938  hypothetical protein  46.81 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>