17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0246 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000101451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0230  hypothetical protein  98.92 
 
 		 93 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4303  hypothetical protein  72.34 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1309  hypothetical protein  61.05 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000111505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0025  hypothetical protein  61.7 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000995703  normal  0.852253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3335  hypothetical protein  58.51 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0373  hypothetical protein  32.26 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0598173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0371  conserved hypothetical protein (DUF507 domain protein)  34.41 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1079  hypothetical protein  32.67 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0896  hypothetical protein  30.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2785  hypothetical protein  31.68 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1924  protein of unknown function DUF507  29.03 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0718  competence/damage-inducible domain-containing protein  27.96 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1366  hypothetical protein  24.73 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1843  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1487  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1668  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>