198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3876 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3876  fructose 1,6-bisphosphatase II  100 
 
 
351 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0849  fructose 1,6-bisphosphatase II  88.67 
 
 
353 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0465211  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8487  Fructose-bisphosphatase  74.04 
 
 
344 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31520  fructose 1,6-bisphosphatase II  70.64 
 
 
350 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0903964  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3072  fructose-1,6-bisphosphatase  72.4 
 
 
346 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1877  fructose 1,6-bisphosphatase II  74.31 
 
 
349 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.878779  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1066  fructose 1,6-bisphosphatase II  70.62 
 
 
339 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8277  fructose 1,6-bisphosphatase II  72.62 
 
 
343 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.048126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1085  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  71.88 
 
 
350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1003  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  72.45 
 
 
350 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1119  fructose 1,6-bisphosphatase II  70.66 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.614977  normal  0.855236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0724  fructose 1,6-bisphosphatase II  69.85 
 
 
350 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0464  fructose 1,6-bisphosphatase II  73.62 
 
 
341 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.932299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0114  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  71.52 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11120  fructose 1,6-bisphosphatase II  66.15 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4648  fructose 1,6-bisphosphatase II  66.15 
 
 
342 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1674  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  67.91 
 
 
331 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4121  fructose 1,6-bisphosphatase II  63.91 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4196  fructose 1,6-bisphosphatase II  63.91 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.647525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4352  fructose 1,6-bisphosphatase II  65.54 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320831  normal  0.126541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1255  fructose 1,6-bisphosphatase II  64.52 
 
 
345 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000266658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1184  fructose 1,6-bisphosphatase II  64.22 
 
 
345 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2066  fructose 1,6-bisphosphatase II  64.62 
 
 
342 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655843  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20440  fructose 1,6-bisphosphatase II  69.11 
 
 
328 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.51035  normal  0.537147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3119  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  66.56 
 
 
340 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1134  fructose-1,6-bisphosphatase class II  65.22 
 
 
332 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1013  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  62.65 
 
 
328 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0820  fructose 1,6-bisphosphatase II  64.62 
 
 
343 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.827682  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05200  fructose 1,6-bisphosphatase II  63.35 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0875  fructose 1,6-bisphosphatase II  64.31 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2483  fructose 1,6-bisphosphatase II  62.8 
 
 
350 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01960  fructose 1,6-bisphosphatase II  66.35 
 
 
330 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1792  fructose 1,6-bisphosphatase II  58.95 
 
 
329 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0653  fructose 1,6-bisphosphatase II  57.76 
 
 
325 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0143338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5302  fructose 1,6-bisphosphatase II  61.9 
 
 
338 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4129  fructose 1,6-bisphosphatase II  60.25 
 
 
329 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142899  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1213  fructose 1,6-bisphosphatase II  59.94 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3378  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.66 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3256  hypothetical protein  54.83 
 
 
329 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552771  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5172  fructose 1,6-bisphosphatase II  56.21 
 
 
366 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4688  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  56.83 
 
 
332 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0422847  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1866  fructose 1,6-bisphosphatase II  52.62 
 
 
326 aa  340  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3854  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.46 
 
 
321 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000181718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5511  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.46 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000902991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5456  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000446335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5496  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484308  unclonable  7.90182e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5462  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0753  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.69 
 
 
327 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5182  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5017  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5033  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.518468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5576  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000266244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5131  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.14 
 
 
321 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267137  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2876  fructose 1,6-bisphosphatase II  54.69 
 
 
323 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000450051  hitchhiker  0.000000285517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0850  fructose 1,6-bisphosphatase II  52 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0442913  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1796  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.38 
 
 
327 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000328432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1592  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.15 
 
 
327 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0188  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.08 
 
 
327 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00461143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3330  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.67 
 
 
320 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0599987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0866  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.46 
 
 
338 aa  322  7e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3440  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.99 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4837  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.71 
 
 
330 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2220  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.12 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.742385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1640  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.44 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2308  fructose 1,6-bisphosphatase II  52.81 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2409  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.5 
 
 
328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1352  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.8 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1793  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.76 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0102519  normal  0.140002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2334  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.41 
 
 
319 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.01409e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3560  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  301  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5099  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4830  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0205836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4671  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4688  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000315487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5195  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0134  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181933  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5104  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5066  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5105  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.88 
 
 
323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.896265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4783  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.24 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3000  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.59 
 
 
320 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231089  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1639  fructose-1,6-bisphosphatase class II  51.46 
 
 
330 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000123037  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1297  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.44 
 
 
328 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.602104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2503  fructose 1,6-bisphosphatase II  49.71 
 
 
341 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.208144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2171  fructose 1,6-bisphosphatase II  51.09 
 
 
321 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2918  fructose 1,6-bisphosphatase II  53.04 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208957  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1876  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.3 
 
 
334 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0404  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.62 
 
 
321 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2058  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.62 
 
 
321 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2965  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.93 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3997  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.35 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12700  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.16 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2784  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.93 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2252  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  47.84 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0833  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.71 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2496  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.63 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.427198  normal  0.0990959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1876  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.38 
 
 
321 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.758905  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2947  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.96 
 
 
324 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462493  hitchhiker  0.00356506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2165  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.43 
 
 
327 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0746  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.33 
 
 
329 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0803274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>