253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1406 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1406  cell division protein MraZ  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00827129  hitchhiker  0.00155584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5107  cell division protein MraZ  87.41 
 
 
143 aa  268  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373154  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2935  MraZ protein  73.43 
 
 
143 aa  230  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000665289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1101  cell division protein MraZ  72.73 
 
 
143 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1398  MraZ protein  72.73 
 
 
143 aa  229  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816682  normal  0.0107217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2861  cell division protein MraZ  72.03 
 
 
143 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1001  cell division protein MraZ  70.92 
 
 
144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0954515  normal  0.226579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0887  MraZ protein  70.63 
 
 
143 aa  216  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2662  MraZ protein  67.38 
 
 
143 aa  207  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16650  mraZ protein  63.64 
 
 
143 aa  206  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.103702  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3447  cell division protein MraZ  66.9 
 
 
142 aa  204  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0414868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3221  cell division protein MraZ  66.2 
 
 
142 aa  202  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3208  cell division protein MraZ  61.54 
 
 
143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000170601  normal  0.0171903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13690  cell division protein MraZ  60.84 
 
 
143 aa  194  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1587  MraZ protein  61.15 
 
 
157 aa  187  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1561  cell division protein MraZ  58.04 
 
 
142 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1065  MraZ protein  55 
 
 
150 aa  184  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1562  cell division protein MraZ  56.64 
 
 
142 aa  183  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5775  MraZ protein  58.74 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22890  mraZ protein  56.34 
 
 
154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544234  normal  0.034348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24980  mraZ protein  57.34 
 
 
143 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10720  mraZ protein  57.34 
 
 
143 aa  175  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1275  MraZ protein  53.57 
 
 
155 aa  173  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1652  MraZ protein  51.72 
 
 
148 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1110  protein MraZ  47.55 
 
 
270 aa  156  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.701807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0172  hypothetical protein  48.59 
 
 
173 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2655  MraZ protein  52.45 
 
 
143 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.895662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2419  MraZ protein  47.89 
 
 
143 aa  149  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.0439129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3072  MraZ protein  50.74 
 
 
144 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12196  cell division protein MraZ  47.55 
 
 
143 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.435477  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09000  MraZ protein  43.7 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3265  cell division protein MraZ  45.45 
 
 
143 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3327  cell division protein MraZ  45.45 
 
 
143 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3276  cell division protein MraZ  45.45 
 
 
143 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3532  cell division protein MraZ  47.65 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0208024  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0743  cell division protein MraZ  41.01 
 
 
143 aa  135  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.153316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2979  cell division protein MraZ  47.65 
 
 
144 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182358  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0817  hypothetical protein  43.17 
 
 
143 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1210  cell division protein MraZ  38.41 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.192448  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  41.01 
 
 
143 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3026  MraZ protein  47.69 
 
 
146 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.20935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1617  MraZ protein  47.06 
 
 
144 aa  130  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1295  MraZ protein  41.01 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1501  hypothetical protein  44.12 
 
 
151 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00904866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3271  MraZ protein  49.65 
 
 
144 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000275591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1045  MraZ protein  40.29 
 
 
145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1237  cell division protein MraZ  41.73 
 
 
143 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1262  cell division protein MraZ  41.73 
 
 
143 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2018  cell division protein MraZ  39.13 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0584  cell division protein MraZ  36.23 
 
 
142 aa  123  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0666  cell division protein MraZ  40.29 
 
 
142 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0834  cell division protein MraZ  43.17 
 
 
143 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.54539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0982  cell division protein MraZ  37.68 
 
 
143 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.504694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4072  cell division protein MraZ  40.29 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  39.86 
 
 
143 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3934  MraZ protein  41.18 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0143451  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  38.41 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3520  MraZ protein  40.58 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0340  MraZ  38.69 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000320074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1573  MraZ protein  38.13 
 
 
149 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0475  cell division protein MraZ  37.68 
 
 
143 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000349063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0765  cell division protein MraZ  39.53 
 
 
142 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_281  MraZ protein  37.23 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000252688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0319  MraZ protein  37.23 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1445  MraZ protein  40.65 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0153914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0769  cell division protein MraZ  34.78 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0735205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1152  cell division protein MraZ  36.23 
 
 
143 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1208  MraZ protein  36.5 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2843  MraZ protein  43.55 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1501  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  41.8 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1996  MraZ protein  41.13 
 
 
144 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.359835  normal  0.384636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1984  MraZ protein  36.69 
 
 
143 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1681  MraZ protein  40.16 
 
 
144 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1256  MraZ protein  35.71 
 
 
146 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00006423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2615  MraZ protein  36.36 
 
 
151 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0760  cell division protein MraZ  37.41 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.776691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2437  cell division protein MraZ  38.35 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  40.31 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6970  MraZ protein  35.17 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1197  cell division protein MraZ  35.29 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000030245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  32.21 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  36.84 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2709  MraZ protein  31.69 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0155506  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  36.84 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2461  cell division protein MraZ  35.88 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  33.85 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3462  MraZ protein  36.69 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0788  MraZ protein  35.25 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0345  cell division protein MraZ  35.07 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.296639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0346  cell division protein MraZ  33.83 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  34.72 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0863  MraZ protein  31.16 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  34.46 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  34.46 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  34.46 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2749  mraZ-like  30.77 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3098  cell division protein MraZ  36.51 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2733  cell division protein MraZ  36.51 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4228  cell division protein MraZ  34.56 
 
 
152 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>