74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1494 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1494  ribosomal protein L33  100 
 
 		 54 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.877508  normal  0.191155 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  48.21 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0469  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0639  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000258953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 		 48 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0484  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  44.64 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 49 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  50 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  44.64 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  42.31 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  39.58 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  39.58 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  40.91 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 49 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  38.46 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 54 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  45.83 
 
 		 49 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  36.54 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  40 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  41.67 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  36.54 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0362  ribosomal protein L33  47.62 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  41.07 
 
 		 56 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0687  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 49 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 49 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 54 aa  40  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0666  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>