16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3061 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3061  protein of unknown function DUF86  100 
 
 
125 aa  253  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  29.66 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  34.92 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  33.82 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  27.03 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  36.51 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  43.9  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  28.21 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1103  hypothetical protein  35.48 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  32.43 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  27.59 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  29.17 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  31.13 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  26.47 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>