17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0179 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0176  cellulose biosynthesis protein BcsF  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03338  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.877418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4025  cellulose biosynthesis protein BcsF  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4903  cellulose biosynthesis protein BcsF  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3846  cellulose biosynthesis protein BcsF  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904121 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3999  cellulose biosynthesis protein BcsF  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03385  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3896  cellulose biosynthesis operon protein BcsF/YhjT  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4000  hypothetical protein  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.839609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3832  celllulose biosynthesis operon protein BcsF/YhjT  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3818  celllulose biosynthesis operon protein BcsF/YhjT  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.58538  normal  0.173243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3940  celllulose biosynthesis operon protein BcsF/YhjT  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.886678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3934  putative inner membrane protein  72.58 
 
 		 64 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.850568  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0144  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0077  celllulose biosynthesis operon protein BcsF/YhjT  35.48 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0080  hypothetical protein  32.81 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>