12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_D0001 on replicon NC_010487
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010487  EcSMS35_D0001  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.58929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0362  hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.803779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0325  hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00266  predicted inner membrane protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3296  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.846595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3313  hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00269  hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2448  hypothetical protein  23.68 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148926  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2402  hypothetical protein  24.23 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0254772  hitchhiker  0.000122991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2446  hypothetical protein  23.79 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  hitchhiker  0.00000111119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2560  putative inner membrane protein  23.79 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0155895  hitchhiker  0.000118192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2357  putative inner membrane protein  23.79 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000126369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>