41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3033 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3033  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0792  protein of unknown function DUF437  97.09 
 
 
103 aa  205  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0809  hypothetical protein  97.09 
 
 
103 aa  205  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34364  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4192  hypothetical protein  97.09 
 
 
103 aa  205  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02732  hypothetical protein  96.12 
 
 
103 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.685634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3227  hypothetical protein  96.12 
 
 
103 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02695  hypothetical protein  96.12 
 
 
103 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.685116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3059  hypothetical protein  96.12 
 
 
103 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3321  hypothetical protein  95.15 
 
 
103 aa  201  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3207  hypothetical protein  87.38 
 
 
104 aa  189  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3282  hypothetical protein  87.38 
 
 
103 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3387  hypothetical protein  87.38 
 
 
104 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3285  hypothetical protein  87.38 
 
 
104 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3219  hypothetical protein  86.41 
 
 
103 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3318  hypothetical protein  82.52 
 
 
118 aa  181  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2802  hypothetical protein  64.58 
 
 
102 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2348  hypothetical protein  65.62 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.668511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1631  hypothetical protein  65.62 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2444  hypothetical protein  65.62 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2524  hypothetical protein  56.31 
 
 
105 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2517  hypothetical protein  56.31 
 
 
105 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1625  hypothetical protein  59.18 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2637  hypothetical protein  54.37 
 
 
105 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1827  hypothetical protein  55.34 
 
 
105 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2278  hypothetical protein  54.37 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1701  hypothetical protein  55.79 
 
 
110 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1700  hypothetical protein  57.14 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1922  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1824  hypothetical protein  50.5 
 
 
105 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2692  hypothetical protein  47.57 
 
 
109 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1494  hypothetical protein  52.04 
 
 
107 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1763  hypothetical protein  43.56 
 
 
105 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0816952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1560  hypothetical protein  47.52 
 
 
104 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0595  hypothetical protein  42 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05196  hypothetical protein  42.16 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1651  hypothetical protein  42.11 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.865304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3436  hypothetical protein  40.4 
 
 
113 aa  84.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.345221  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001315  hypothetical protein  39.22 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1180  hypothetical protein  40.4 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.445201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0075  hypothetical protein  38.61 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1652  hypothetical protein  35.64 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>