17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1242 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1242  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000488919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2554  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00520181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02280  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02319  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1259  hypothetical protein  98.36 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2706  hypothetical protein  97.54 
 
 		 122 aa  246  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2575  hypothetical protein  95.9 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2792  hypothetical protein  95.9 
 
 		 122 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2698  hypothetical protein  86.55 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2674  hypothetical protein  85.71 
 
 		 125 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2632  hypothetical protein  85.71 
 
 		 126 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2583  hypothetical protein  85.71 
 
 		 126 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2804  hypothetical protein  84.87 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0979  hypothetical protein  39.33 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1843  hypothetical protein  43.82 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0631994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2414  hypothetical protein  40.85 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.065518  normal  0.587783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2538  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00251361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>