10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3386 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3386  FimB  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0391  FimB  43.72 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4670  FimB  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4039  FimB  42.28 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0061  fimbrial assembly protein  40.24 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3943  FimB  40.39 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4445  hypothetical protein  40.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.067846  normal  0.474624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5159  type IV pilin accessory protein  29.1 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0870  hypothetical protein  33.9 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>