10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3175 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3175  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  942    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  33.41 
 
 
818 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  32.68 
 
 
911 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0059  hypothetical protein  31.5 
 
 
464 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0583  hypothetical protein  32.28 
 
 
390 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0746  hypothetical protein  29.76 
 
 
451 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000789691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0411  hypothetical protein  25.35 
 
 
607 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1178  hypothetical protein  26.09 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.318203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2000  hypothetical protein  25.69 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.245805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2502  hypothetical protein  20.5 
 
 
457 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>