More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0034 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  86.01 
 
 		 1554 bp  842    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1554 bp  850    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  86.01 
 
 		 1554 bp  842    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1554 bp  835    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1562 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1554 bp  835    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1508 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1508 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1508 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1508 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1508 bp  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1508 bp  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1508 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1562 bp  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1510 bp  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1555 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1562 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1510 bp  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1509 bp  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1503 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1503 bp  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1545 bp  1027    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1503 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1510 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1510 bp  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1510 bp  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1562 bp  1027    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1555 bp  1027    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1507 bp  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 1507 bp  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1506 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1507 bp  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SK  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1507 bp  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1545 bp  1027    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1545 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1545 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1521 bp  944    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 1521 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1521 bp  944    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1545 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 1521 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1545 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1555 bp  1027    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  90.84 
 
 		 1612 bp  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1555 bp  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 1530 bp  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 1689 bp  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1544 bp  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>