17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2214 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  230  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.33 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0358848  normal  0.992852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.9 
 
 		 105 aa  153  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.543619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2086  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.57 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0761  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.57 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635476  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1305  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.8 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.675422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1591  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.8 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768665  normal  0.0150332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1914  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1960  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1894  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.407369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.84 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531234  normal  0.0179673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1686  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1704  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.653173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2527  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00497835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5024  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>