13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3299 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3299  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000900607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4920  hypothetical protein  78.26 
 
 
46 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0870  hypothetical protein  81.4 
 
 
46 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0907  hypothetical protein  73.91 
 
 
46 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000583198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0622  hypothetical protein  72.09 
 
 
47 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000662546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0533  hypothetical protein  74.42 
 
 
46 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000797375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0068  hypothetical protein  65.96 
 
 
50 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000534426  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2207  hypothetical protein  68.89 
 
 
49 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000625485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1007  hypothetical protein  65.22 
 
 
49 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2199  hypothetical protein  65.91 
 
 
46 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1910  hypothetical protein  65.91 
 
 
46 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1787  hypothetical protein  60.87 
 
 
45 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000484468  hitchhiker  0.00675318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0028  hypothetical protein  61.9 
 
 
45 aa  50.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.684532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>