14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0984 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0984  TOPRIM  100 
 
 
333 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1410  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2457  TOPRIM domain protein  49.38 
 
 
318 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000035601  unclonable  0.000000000410287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0358  TOPRIM  46.65 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000814037  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  35.25 
 
 
407 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2405  hypothetical protein  34.27 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0373839  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0156  hypothetical protein  23.86 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000439773 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0183  putative DNA primase  25.25 
 
 
433 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0214  DNA primase  25.77 
 
 
438 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0033  hypothetical protein  29.52 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0125  hypothetical protein  29.52 
 
 
438 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000340794 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0099  hypothetical protein  24.73 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1568  DNA primase  30.61 
 
 
99 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0361207  normal  0.323261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  22.63 
 
 
777 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>