12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2270 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2270  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1380  hypothetical protein  38.1 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00610797  normal  0.994283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3207  hypothetical protein  36.62 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08910  hypothetical protein  35.38 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0159  hypothetical protein  32.81 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1316  addiction module component, TIGR02574 family  36.51 
 
 
68 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.18966  normal  0.83687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1603  hypothetical protein  32.73 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2633  hypothetical protein  33.82 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1049  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1935  hypothetical protein  27.78 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1050  hypothetical protein  30.51 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>