14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1500 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1500  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1618  hypothetical protein  98.41 
 
 
63 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.507135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1364  hypothetical protein  92.06 
 
 
63 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1705  hypothetical protein  50.79 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0294  hypothetical protein  46.67 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.387296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1537  hypothetical protein  38.89 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3090  hypothetical protein  43.86 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.922215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3104  hypothetical protein  44.64 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3350  hypothetical protein  44.64 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3320  hypothetical protein  43.86 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0647  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2036  hypothetical protein  45.61 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0708592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4385  hypothetical protein  42.55 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0260298  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2112  hypothetical protein  37.04 
 
 
65 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>