50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1315 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1315  reductive dehalogenase anchoring protein  100 
 
 
89 aa  174  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1398  reductive dehalogenase anchoring protein  100 
 
 
89 aa  174  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0508329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1323  reductive dehalogenase anchoring protein  60.67 
 
 
90 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.208232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1534  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  85.39 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1426  reductive dehalogenase anchoring protein  57.3 
 
 
89 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00712862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1259  reductive dehalogenase anchoring protein  57.3 
 
 
89 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0319  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  48.86 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.045097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0307  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  47.78 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1392  reductive dehalogenase anchoring protein  54.17 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000655295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1377  reductive dehalogenase anchoring protein  44.94 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1307  reductive dehalogenase anchoring protein  45.35 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1326  reductive dehalogenase anchoring protein  47.89 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1518  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  42.05 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.217983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1537  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  43.18 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1374  reductive dehalogenase anchoring protein  43.18 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1343  reductive dehalogenase anchoring protein  50.72 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1341  reductive dehalogenase anchoring protein  50.72 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0283  hypothetical protein  40.7 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1262  reductive dehalogenase anchoring protein  40.91 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1544  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  39.77 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1401  reductive dehalogenase anchoring protein  44.44 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000581103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_98  reductive dehalogenase anchoring protein  38.64 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0103  hypothetical protein  34.12 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.16047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1352  reductive dehalogenase anchoring protein  44.44 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0303  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  41.27 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0312  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  34.52 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1363  reductive dehalogenase anchoring protein  40.85 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0120  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1429  reductive dehalogenase anchoring protein  45.45 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1370  reductive dehalogenase anchoring protein  42.03 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0277  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1521  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  43.82 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.220887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_103  reductive dehalogenase anchoring protein  39.53 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1319  reductive dehalogenase anchoring protein  39.44 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0282  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1527  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  35.29 
 
 
95 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0297  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_87  reductive dehalogenase anchoring protein  39.53 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1435  reductive dehalogenase anchoring protein  40.23 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0875  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  38.64 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.328345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1558  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  44.94 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1339  reductive dehalogenase anchoring protein  33.72 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1386  reductive dehalogenase anchoring protein  41.76 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0111  hypothetical protein  31.4 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1420  reductive dehalogenase anchoring protein  42.86 
 
 
90 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0287032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1382  reductive dehalogenase anchoring protein  43.02 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1313  reductive dehalogenase anchoring protein  38.46 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_81  reductive dehalogenase anchoring protein  32.18 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_97  reductive dehalogenase anchoring protein  38.57 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0078  trichloroethene reductive dehalogenase anchoring protein, putative  35 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.239502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>