12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3857 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  303  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0901249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0193  hypothetical protein  57.72 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2188  hypothetical protein  52.31 
 
 		 280 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2475  hypothetical protein  51.54 
 
 		 280 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0403  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0855  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1145  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0314  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2120  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1852  hypothetical protein  48.39 
 
 		 222 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0888075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2752  hypothetical protein  44.12 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2169  hypothetical protein  45.83 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>