12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3246 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000756504  hitchhiker  0.00000000213458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3541  hypothetical protein  35.77 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1885  hypothetical protein  36.64 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3714  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3410  hypothetical protein  31.06 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  8.47727e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4088  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1226  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2784  hypothetical protein  35.82 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2413  hypothetical protein  31.39 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2418  hypothetical protein  26.85 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>