22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1216 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1216  CRISPR-associated Csy4 family protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0484  CRISPR-associated Csy4 family protein  64.92 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0468499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3654  CRISPR-associated protein, Csy4 family  47.31 
 
 		 184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1455  CRISPR-associated Csy4 family protein  52.63 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0322506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0701  CRISPR-associated protein, Csy4 family  49.19 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.769772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0729  CRISPR-associated protein, Csy4 family  48.11 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2452  CRISPR-associated protein, Csy4 family  50.54 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1649  CRISPR-associated Csy4 family protein  44.86 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1723  hypothetical protein  44.86 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0360292  hitchhiker  0.00075571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1540  CRISPR-associated protein, Csy4 family  44.86 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1406  CRISPR-associated Csy4 family protein  41.4 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.051727  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1102  hypothetical cytosolic protein  43.98 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33300  hypothetical protein  48.5 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000948839  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1400  CRISPR-associated Csy4 family protein  36.79 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0047  hypothetical protein  35.14 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.300747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2842  hypothetical protein  34.59 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1947  hypothetical cytosolic protein  34.41 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0251  CRISPR-associated Csy4 family protein  33.87 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2686  CRISPR-associated Csy4 family protein  34.01 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1823  CRISPR-associated Csy4 family protein  33.51 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3372  CRISPR-associated Csy4 family protein  31.61 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641496  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3236  CRISPR-associated Csy4 family protein  30.57 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>