42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2628 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2628  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3094  SpoVG family protein  84.15 
 
 
83 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.729393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2814  regulatory protein SpoVG  80.72 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0585  regulatory protein SpoVG  81.48 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000114676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2500  regulatory protein SpoVG  78.31 
 
 
90 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2399  regulatory protein SpoVG  70.11 
 
 
88 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0109  SpoVG family protein  76.54 
 
 
93 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000363253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0044  regulatory protein SpoVG  66.27 
 
 
96 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0042  regulatory protein SpoVG  66.27 
 
 
96 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0067  SpoVG family protein  70.37 
 
 
88 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.746484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0043  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0043  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000554431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0090  SpoVG family protein  70.37 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0054  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5263  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.875074  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0053  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0057  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0047  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0043  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0043  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0047  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0046  regulatory protein SpoVG  63.86 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0098  SpoVG family protein  65.48 
 
 
84 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0177  SpoVG family protein  66.25 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0204  SpoVG family protein  66.67 
 
 
85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0127981  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0532  regulatory protein SpoVG  59.26 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000987509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0519  regulatory protein SpoVG  59.26 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000118808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0136  regulatory protein SpoVG  59.26 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0152707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21260  SpoVG family protein  59.26 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58874e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0095  SpoVG family protein  54.76 
 
 
99 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000535808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1339  stage V sporulation protein G  50.62 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0814  regulatory protein SpoVG  50.6 
 
 
97 aa  92  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000364553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0126  regulatory protein SpoVG  51.85 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0625179  normal  0.55282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0129  regulatory protein SpoVG  50.62 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0140  regulatory protein SpoVG  50.62 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.691026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0122  regulatory protein SpoVG  50.62 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0502  SpoVG family protein  48.75 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000018214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0059  SpoVG family protein  43.53 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1482  SpoVG family protein  37.65 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2781  SpoVG family protein  39.47 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.481014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2770  SpoVG family protein  33.33 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0396  putative stage V sporulation protein G  29.55 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>