12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1924 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1924    100 
 
 
1219 bp  2416    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2037    89 
 
 
1529 bp  567  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.620147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2756  transposase  94.25 
 
 
261 bp  398  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1902  transposase  81.03 
 
 
279 bp  56  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1998  transposase mutator type  82.61 
 
 
1224 bp  56  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0886    87.5 
 
 
1332 bp  56  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000130301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0334    83.12 
 
 
1225 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0414    83.12 
 
 
1226 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0484    83.12 
 
 
1226 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0611    83.12 
 
 
1226 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  83.12 
 
 
1224 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2222    83.12 
 
 
1224 bp  50.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>