14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3933 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95807  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2997  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1877 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0363  hypothetical protein  39.16 
 
 		 1266 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0670  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1248 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.576207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3940  hypothetical protein  34.34 
 
 		 178 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5242  hypothetical protein  35.96 
 
 		 596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000221753  hitchhiker  0.0000000135366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0664  hypothetical protein  35.09 
 
 		 480 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3161  hypothetical protein  31.32 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  101  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1672  hypothetical protein  31.61 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2456  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1444 aa  91.3  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0154733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1048  hypothetical protein  30.77 
 
 		 512 aa  90.9  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3603  hypothetical protein  31.36 
 
 		 496 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000547172 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1806  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1561 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>