18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3842 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  308  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.262534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0305  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0885  putative prophage Lp2 protein 26  37.23 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3519  hypothetical protein  38.37 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2880  hypothetical protein  28.28 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0806  hypothetical protein  28.28 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1045  hypothetical protein  40.51 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1064  hypothetical protein  40.51 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0330  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.614067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0339  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.729949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1434  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0645  YopX protein  35.37 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2223  YopX protein  35.37 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0572  hypothetical protein  34.52 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2955  hypothetical protein  30.87 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0062  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.760214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2567  hypothetical protein  30.99 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0696  hypothetical protein  34.18 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>