18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1441 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  49.17 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  49.44 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  42.63 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  45.16 
 
 
190 aa  170  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  41.9 
 
 
193 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  43.78 
 
 
190 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  36.11 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  35.52 
 
 
190 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  36.46 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  34.62 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  36.41 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  31.67 
 
 
189 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  31.18 
 
 
192 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  31.89 
 
 
194 aa  103  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  30.22 
 
 
190 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1126  hypothetical protein  34.51 
 
 
133 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000923187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>