13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1271 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1271  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.135008  normal  0.0172039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1581  hypothetical protein  53.85 
 
 
57 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1697  hypothetical protein  65.79 
 
 
50 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0991  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1500  hypothetical protein  46.67 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1106  hypothetical protein  52.94 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1531  hypothetical protein  52.5 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.707315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0775  hypothetical protein  53.85 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0918  hypothetical protein  47.5 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1450  hypothetical protein  47.22 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.330959  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1185  hypothetical protein  43.48 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000250834  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1444  hypothetical protein  47.62 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  53.85 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>