16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1270 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  68.59 
 
 
277 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  67.39 
 
 
277 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  66.19 
 
 
280 aa  371  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  52 
 
 
273 aa  300  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  57.6 
 
 
221 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  63.12 
 
 
160 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  57.45 
 
 
175 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  34.17 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  31.77 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  33.5 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  36.43 
 
 
212 aa  85.9  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  31.94 
 
 
177 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2873  hypothetical protein  28.81 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  31.51 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0079  hypothetical protein  28.68 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>