27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0464 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1461  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.776402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0521  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0464  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.465756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1263  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1519  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_r01  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0041  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1728  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.52798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1715  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_r02  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_r03  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123839  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1708  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1799  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1802  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1805  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2320  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2256  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.335149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2239  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0889866  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2159  5S ribosomal RNA  85.51 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2229  5S ribosomal RNA  85.51 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2186  5S ribosomal RNA  85.51 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0034  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0056  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0213918  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0155  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0021  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0509  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.643025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0595  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.162254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>