14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3295 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3048  hypothetical protein  99.53 
 
 
643 aa  1337    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3295  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1340    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0952  putative phage minor capsid protein  51.93 
 
 
545 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.217615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1650  hypothetical protein  26.61 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03833  hypothetical protein  28.18 
 
 
2710 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  32.12 
 
 
3754 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_003296  RS05403  hypothetical protein  28.17 
 
 
2208 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166405  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02084  hypothetical protein  30.67 
 
 
2483 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2624  hypothetical protein  32.29 
 
 
473 aa  65.1  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000820032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1839  hypothetical protein  29.79 
 
 
2497 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2969  SPP1 family phage head morphogenesis protein  35.62 
 
 
518 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05479  hypothetical protein  25 
 
 
2338 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0543187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3401  hypothetical protein  25 
 
 
2353 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3906  hypothetical protein  27.43 
 
 
294 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.382654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>