18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4009 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4009  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  827    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4146  hypothetical protein  49.04 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2655  hypothetical protein  43.34 
 
 
378 aa  309  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0703  hypothetical protein  39.92 
 
 
381 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1318  hypothetical protein  28.7 
 
 
337 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.889926  normal  0.0248237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0838  hypothetical protein  27.87 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.23349  normal  0.0364981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3074  hypothetical protein  28.41 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.340992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0600  hypothetical protein  26.05 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2915  hypothetical protein  30.8 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1707  DNA repair and recombination protein RadA  30.13 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0041  hypothetical protein  28.77 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1706  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1386  hypothetical protein  27.81 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000644457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1330  hypothetical protein  25.97 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1705  hypothetical protein  29.11 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0907  hypothetical protein  24.06 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0733644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0594  hypothetical protein  22.07 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1489  hypothetical protein  27.68 
 
 
422 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.627679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>