27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2087 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
252 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0517  GCN5-related N-acetyltransferase  27.72 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
147 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  42.19 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.19 
 
 
98 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  49.09 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.06 
 
 
148 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
164 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.64 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.56 
 
 
139 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.84 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.63 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1242  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29 
 
 
163 aa  42.4  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.06 
 
 
147 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>