26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4345 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4345  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0837265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3707  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.94 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00576241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3538  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.94 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000633117  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3539  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.94 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3645  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.94 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3610  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.94 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3799  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  29.08 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000130296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0473  protein of unknown function DUF1043  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000169791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03044  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4550  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000433662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3543  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000300474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3529  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0473  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0195493  normal  0.11204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3422  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3668  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.22 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000236869  normal  0.162694 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03093  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00505365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3716  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  30.43 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4351  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  25 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00465453  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3641  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  29.37 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0290  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  27.97 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0297  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  27.97 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000113231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00879  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  21.85 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004513  hypothetical protein  22.52 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0881  hypothetical protein  28.05 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3597  hypothetical protein  24.72 
 
 		 118 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00340533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  29.79 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>