30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0269 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0269  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000581001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0278  hypothetical protein  98.99 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00110569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0574  hypothetical protein  26.84 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2901  Domain of unknown function DUF1836  23.75 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000399756  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0941  BS_ykrK family protein  25.29 
 
 
158 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.253763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1318  hypothetical protein  31.58 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1942  hypothetical protein  26.42 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.318368  normal  0.0759806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3211  hypothetical protein  24.43 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000281051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1353  hypothetical protein  24.74 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.723305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5148  hypothetical protein  22.4 
 
 
186 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0726043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1724  hypothetical protein  23.4 
 
 
184 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0569422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5702  hypothetical protein  22.8 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1931  hypothetical protein  25.45 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00153236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5306  hypothetical protein  22.8 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5246  hypothetical protein  22.8 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1452  hypothetical protein  25.77 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00758898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5133  hypothetical protein  22.28 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000775312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2602  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00407807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2567  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00114926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5638  hypothetical protein  22.28 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5576  hypothetical protein  22.28 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2848  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2651  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000219779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2841  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.185218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2645  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00303485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2893  hypothetical protein  24.24 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.74643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5547  hypothetical protein  22.28 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2871  hypothetical protein  24.24 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2854  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00218141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2439  hypothetical protein  24.85 
 
 
254 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0328817  normal  0.606063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>